单纯疱疹病毒直径约为120-150微米，由含有DNA的核于中间，向外依次由包膜、体被、衣壳三种同心结构组成，衣壳表面为162个壳微粒组成的3:3:2轴对称的20面体，体被由纤维质构成，包膜有时来自细胞核，有时来自细胞膜，细胞膜内含有脂成份，所以单纯疱疹病毒对乙醚及脂溶剂特别敏感。对高温和低PH都不稳定，在低温下可生存数月，湿热50℃及干燥90℃30分钟灭活。
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单纯疱疹病毒可分为Ⅰ型和Ⅱ型二种，Ⅰ型疱疹病主要是通过呼吸道、皮肤和粘膜密切接触传播，感染腰以上部位的皮肤粘膜和器官。如引起口唇粘膜、鼻前庭、眼结膜、咽喉部的炎症及疱疹，口和口周围发生的疱疹，99%是由Ⅰ型疱疹病毒感染引起的。Ⅱ型疱疹病毒主要存在于男性的阴茎、尿道等处，是引起生殖器发炎和疱疹的罪魁祸首。
据有关统计资料显示，生殖器疱疹的病原体90%为Ⅱ型疱疹病毒，仅10%为Ⅰ型疱疹病毒。经性器官接触后，潜伏约2-20天（平均6天），有免疫缺陷或免疫功能不全的人，如应用免疫抑制剂、肾移植、严重烧伤、重度营养不良、血液淋巴系统恶性肿瘤病人等，感染单纯疱疹病毒后症状加重，可出现疱疹性湿疹、复发性角膜溃疡，甚至全身播散性疱疹而致命。
感染1-3周后体内产生中和抗体及补体结合抗体，残存的病毒可能向周围神经沿神经轴转入三叉神经节（Ⅰ型疱疹病毒）或骶神经节（Ⅱ型疱疹病毒），而长期潜伏，进入静止状态。当某种诱发因素如焦虑、精神创伤、受凉、日晒、吹风、创伤、感染、药物过敏、高热、月经、妊娠等破坏身体生理平衡时，神经细胞中出现病毒增殖所需的特异性转录酶，激活病毒而引起复发，体液抗体不能制止疱疹病毒复发，细胞免疫减弱对复发有重大影响。
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